Selbst professionelle Rennfahrer verlieren gelegentlich den Überblick, in welchem Gang sie gerade sind. Der große Gangpositionssensor und die numerische Anzeige liefern dem Fahrer auf Anhieb die richtige Information.

Während die Struktur des Hauptrahmens gegenüber dem des Vorgängermodells im Wesentlichen unverändert blieb, wurde durch die überarbeitete Steifigkeit um den Schwingendrehpunkt und die hintere Motoraufhängung die Steifigkeitsbalance zwischen vorn und hinten optimiert. Der Motor ist mit einem steileren Zylinderneigungswinkel montiert. Er wurde quasi um die Ausgangswelle gedreht und vorn angehoben, so dass der Schwerpunkt des Motors um 16 mm und das Lenkkopfrohr um 10 mm höher liegen. Das Ergebnis ist eine verbesserte Kurven-Performance und ein leichteres Einlenkverhalten.

Große, halbschwimmend gelagerte Edelstahl-Bremsscheiben im Petal-Design mit 300 mm Durchmesser liefern erstklassige Bremsleistung. Mit 6 mm Stärke widerstehen diese Bremsscheiben den anspruchsvollsten Belastungen des Rennstreckeneinsatzes. Leistungsstarke, radial montierte Bremssättel sorgen für ein sehr direktes Gefühl am Bremshebel. Der Radialpumpen-Hauptbremszylinder bürgt für einen exakten Druckpunkt und überragende Kontrolle. Hinten verzögert eine 220 mm-Bremsscheibe im Petal-Design.

Hinzugekommen sind zylindrisch geformte Führungen auf der Oberseite des Luftfiltergehäuses, die für genauer zerstäubten Kraftstoffnebel aus den Sekundär-Einspritzdüsen sorgen. Da der Kraftstoff präziser in die Einlasskanäle geleitet wird, ergibt sich eine verbesserte Verbrennungseffizienz.

Die BPF-Gabel trägt wesentlich zum hervorragenden Bremsverhalten der Ninja ZX-6R bei. Im Vergleich zu einer herkömmlichen Cartridge-Gabel derselben Größe verfügt die BPF-Gabel über einen Hauptkolben von fast doppelter Größe (Ø 37 mm gegenüber Ø 20 mm an der Vorgängerin). Die Einstellungen der Druck- und Zugstufendämpfung werden auf der Oberseite jedes Gabelrohrs vorgenommen. Die Vorspannungseinstellung erfolgt jeweils unten an der Gabel.

Die Ansaugtrichter mit einer längeren und einer kürzeren Seite erhöhen die Leistung im mittleren und oberen Drehzahlbereich. Eine optimierte Nitrierung der Nocken (NV) und Stößel mit höherer Haltbarkeit ermöglichen die Verwendung von höher belastbaren Nockenprofilen, was die Gesamtperformance verbessert.

Die einstellbare Rutschkupplung (Back Torque Limiter) hilft, das "Stempeln" des Hinterrads zu verhindern, das beim Herunterschalten aus hohen Drehzahlen auftreten kann.

Serienmäßig ist ein einstellbarer Doppelrohr-Lenkungsdämpfer von Öhlins mit Überdruckventil montiert. Das zweite Rohr, das als Vorratsbehälter dient, und die Innenteile des Dämpfers stellen auch unter Rennbedingungen stabile Dämpfungseigenschaften sicher.